Если не ошибаюсь, модальное окно выводится с помошью java, так как окно связано с ЭЦП(электронно-цифровая подпись). ЭЦП берется с флешки. И все это настроено в БД через java. Как я понимаю проектмейкер работает только с браузерными действиями, но как сделать чтобы ПМ увидел это окно.
На рисунке в первом посте в панели задач приложение без значка это и есть модальное окно