Вжух...Вот решение.
Скорее всего ты написал шаблон змейкой. То есть проект сначала что то делает, потом на основе того что он сделал он делает ещё действия, и т.д.
Сам проект работает. Если в нем есть фалы куда данные добавляются, они добавляются, удаление происходит после окончание скрипта...